DolphinDB 插件开发教程
DolphinDB 支持动态加载外部插件,以扩展系统功能。插件用 C++ 编写,需要编译成 ".so" 或 ".dll" 共享库文件。本文着重介绍如何开发插件,并详细介绍以下几个具体场景的插件开发流程:
如何开发插件
基本概念
DolphinDB 的插件实现了能在脚本中调用的函数。一个插件函数可能是运算符函数(operator function),也可能是系统函数(system function),它们的区别在于,前者接受的参数个数小于等于 2,而后者可以接受任意个参数,并支持会话的访问操作。
开发一个运算符函数,需要编写一个原型为 ConstantSP (const ConstantSP& a, const ConstantSP& b) 的 C++ 函数。当函数参数个数为 2 时,a 和 b 分别为插件函数的第一和第二个参数;当参数个数为 1 时,b 是一个占位符,没有实际用途;当没有参数时,a 和 b 均为占位符。
开发一个系统函数,需要编写一个原型为 ConstantSP (Heap* heap, vector<ConstantSP>& args) 的 C++ 函数。用户在 DolphinDB 中调用插件函数时传入的参数,都按顺序保存在 C++ 的向量 args 中。heap 参数不需要用户传入。
函数原型中的 ConstantSP 可以表示绝大多数 DolphinDB 对象(标量、向量、矩阵、表,等等)。其他常用的派生自它的变量类型有 VectorSP(向量)以及 TableSP(表)等。
开发插件时所需的头文件通常位于 DolphinDBPlugin 项目的 include 目录下,用户可切换至指定版本下载。 此处给出 Gitee 中某版本插件头文件的链接。更多说明可参阅本文 8.常见问题。
创建变量
创建标量,可以直接用 new 语句创建头文件 ScalarImp.h 中声明的类型对象,并将它赋值给一个 ConstantSP。 ConstantSP 是一个经过封装的智能指针,会在变量的引用计数为 0 时自动释放内存,因此,用户不需要手动删除已经创建的变量:
ConstantSP i = new Int(1); // 相当于 1i ConstantSP d = new Date(2019, 3, 14); // 相当于 2019.03.14 ConstantSP s = new String("DolphinDB"); // 相当于 "DolphinDB" ConstantSP voidConstant = new Void(); // 创建一个 void 类型变量,常用于表示空的函数参数
头文件 Util.h 声明了一系列函数,用于快速创建某个类型和格式的变量:
VectorSP v = Util::createVector(DT_INT, 10); // 创建一个初始长度为 10 的 INT 类型向量 v->setInt(0, 60); // 相当于 v[0] = 60 VectorSP t = Util::createVector(DT_ANY, 0); // 创建一个初始长度为 0 的 ANY 类型向量(元组) t->append(new Int(3)); // 相当于 t.append!(3) t->get(0)->setInt(4); // 相当于 t[0] = 4 // 这里不能用 t->setInt(0, 4),因为 t 是一个元组,setInt(0, 4) 只对 INT 类型的向量有效 ConstantSP seq = Util::createIndexVector(5, 10); // 相当于 5..14 int seq0 = seq->getInt(0); // 相当于 seq[0] ConstantSP mat = Util::createDoubleMatrix(5, 10);// 创建一个 10 行 5 列的 DOUBLE 类型矩阵 mat->setColumn(3, seq); // 相当于 mat[3] = seq
异常处理和参数校验
异常处理
插件开发时的异常抛出和处理,和一般 C++ 开发中一样,都通过 throw 关键字抛出异常, try 语句块处理异常。DolphinDB 在头文件 Exceptions.h 中声明了异常类型。插件函数若遇到运行时错误,一般抛出 RuntimeException。
在插件开发时,通常会校验函数参数,如果参数不符合要求,抛出一个 IllegalArgumentException。常用的参数校验函数有:
ConstantSP->getType()
:返回变量的类型(INT, CHAR, DATE 等等),DolphinDB 的类型定义在头文件 Types.h 中。ConstantSP->getCategory()
:返回变量的类别,常用的类别有 INTEGRAL(整数类型,包括 INT, CHAR, SHORT, LONG 等)、FLOATING(浮点数类型,包括 FLOAT, DOUBLE 等)、TEMPORAL(时间类型,包括 TIME, DATE, DATETIME 等)、LITERAL(字符串类型,包括 STRING, SYMBOL 等),都定义在头文件 Types.h 中。ConstantSP->getForm()
:返回变量的格式(标量、向量、表等等),DolphinDB 的格式定义在头文件 Types.h 中。ConstantSP->isVector()
:判断变量是否为向量。ConstantSP->isScalar()
:判断变量是否为标量。ConstantSP->isTable()
:判断变量是否为表。ConstantSP->isNumber()
:判断变量是否为数字类型。ConstantSP->isNull()
:判断变量是否为空值。ConstantSP->getInt()
:获得变量对应的整数值。ConstantSP->getString()
:获得变量对应的字符串。ConstantSP->size()
:获得变量的长度。
更多参数校验函数一般在头文件 CoreConcept.h 的 Constant 类方法中。
参数校验的范例
本节将开发一个插件函数用于求非负整数的阶乘,返回一个 LONG 类型变量。DolphinDB 中 LONG 类型的最大值为 2^63-1,能表示的阶乘最大为 25!,因此只有 0~25 范围内的参数是合法的。
#include "CoreConcept.h" #include "Exceptions.h" #include "ScalarImp.h" ConstantSP factorial(const ConstantSP &n, const ConstantSP &placeholder) { string syntax = "Usage: factorial(n)."; if (!n->isScalar() || n->getCategory() != INTEGRAL) throw IllegalArgumentException("factorial", syntax + "n must be an integral scalar."); int nValue = n->getInt(); if (nValue < 0 || nValue> 25) throw IllegalArgumentException("factorial", syntax + "n must be a non-negative integer less than 26."); long long fact = 1; for (int i = nValue; i> 0; i--) fact *= i; return new Long(fact); }
调用 DolphinDB 内置函数
有时需要调用 DolphinDB 的内置函数对数据进行处理。有些类已经定义了部分常用的内置函数作为方法:
VectorSP v = Util::createIndexVector(1, 100); ConstantSP avg = v->avg(); // 相当于 avg(v) ConstantSP sum2 = v->sum2(); // 相当于 sum2(v) v->sort(false); // 相当于 sort(v, false)
如果需要调用其它内置函数,插件函数的类型必须是系统函数。通过 heap->currentSession()->getFunctionDef 函数获得一个内置函数,然后用 call
方法调用它。如果该内置函数是运算符函数,应调用原型 call(Heap, const ConstantSP&, const ConstantSP&);如果是系统函数,应调用原型 call(Heap, vector<ConstantSP>&)。以下是调用内置函数 cumsum
的一个例子:
ConstantSP v = Util::createIndexVector(1, 100); v->setTemporary(false); //v 的值可能在内置函数调用时被修改。如果不希望它被修改,应先调用 setTemporary(false) FunctionDefSP cumsum = heap->currentSession()->getFunctionDef("cumsum"); ConstantSP result = cumsum->call(heap, v, new Void()); // 相当于 cumsum(v),这里的 new Void() 是一个占位符,没有实际用途
如何开发支持时间序列数据处理的插件函数
DolphinDB 的特色之一在于它对时间序列有良好支持。本章以编写一个 msum 函数的插件为例,介绍如何开发插件函数支持时间序列数据处理。
时间序列处理函数通常接受向量作为参数,并对向量中的每个元素进行计算处理。在本例中,msum
函数接受两个参数:一个向量和一个窗口大小。它的原型是:
ConstantSP msum(const ConstantSP &X, const ConstantSP &window);
msum
函数的返回值是一个和输入向量同样长度的向量。本例为简便起见,假定返回值是一个 DOUBLE 类型的向量。可以通过 Util::createVector 函数预先为返回值分配空间:
int size = X->size(); int windowSize = window->getInt(); ConstantSP result = Util::createVector(DT_DOUBLE, size);
在 DolphinDB 插件编写时处理向量,可以循环使用 getDoubleConst
, getIntConst
等函数,批量获得一定长度的只读数据,保存在相应类型的缓冲区中,从缓冲区中取得数据进行计算。这样做的效率比循环使用 getDouble
, getInt
等函数要高。本例为简便起见,统一使用 getDoubleConst
,每次获得长度为 Util::BUF_SIZE 的数据。这个函数返回一个 const double* ,指向缓冲区头部:
double buf[Util::BUF_SIZE]; INDEX start = 0; while (start < size) { int len = std::min(Util::BUF_SIZE, size - start); const double *p = X->getDoubleConst(start, len, buf); for (int i = 0; i < len; i++) { double val = p[i]; // ... } start += len; }
在本例中,msum
将计算 X 中长度为 windowSize 的窗口中所有数据的和。可以用一个临时变量 tmpSum 记录当前窗口的和,每当窗口移动时,只要给 tmpSum 增加新窗口尾部的值,减去旧窗口头部的值,就能计算得到当前窗口中数据的和。为了将计算值写入 result,可以循环用 result->getDoubleBuffer 获取一个可读写的缓冲区,写完后使用 result->setDouble 函数将缓冲区写回数组。setDouble
函数会检查给定的缓冲区地址和变量底层储存的地址是否一致,如果一致就不会发生数据拷贝。在多数情况下,用 getDoubleBuffer
获得的缓冲区就是变量实际的存储区域,这样能减少数据拷贝,提高性能。
需要注意的是,DolphinDB 用 DOUBLE 类型的最小值(已经定义为宏 DBL_NMIN )表示 DOUBLE 类型的 NULL 值,要专门判断。
返回值的前 windowSize - 1 个元素为 NULL。可以对 X 中的前 windowSize 个元素和之后的元素用两个循环分别处理,前一个循环只计算累加,后一个循环执行加和减的操作。最终的实现如下:
ConstantSP msum(const ConstantSP &X, const ConstantSP &window) { INDEX size = X->size(); int windowSize = window->getInt(); ConstantSP result = Util::createVector(DT_DOUBLE, size); double buf[Util::BUF_SIZE]; double windowHeadBuf[Util::BUF_SIZE]; double resultBuf[Util::BUF_SIZE]; double tmpSum = 0.0; INDEX start = 0; while (start < windowSize) { int len = std::min(Util::BUF_SIZE, windowSize - start); const double *p = X->getDoubleConst(start, len, buf); double *r = result->getDoubleBuffer(start, len, resultBuf); for (int i = 0; i < len; i++) { if (p[i] != DBL_NMIN) // p[i] is not NULL tmpSum += p[i]; r[i] = DBL_NMIN; } result->setDouble(start, len, r); start += len; } result->setDouble(windowSize - 1, tmpSum); // 上一个循环多设置了一个 NULL,填充为 tmpSum while (start < size) { int len = std::min(Util::BUF_SIZE, size - start); const double *p = X->getDoubleConst(start, len, buf); const double *q = X->getDoubleConst(start - windowSize, len, windowHeadBuf); double *r = result->getDoubleBuffer(start, len, resultBuf); for (int i = 0; i < len; i++) { if (p[i] != DBL_NMIN) tmpSum += p[i]; if (q[i] != DBL_NMIN) tmpSum -= q[i]; r[i] = tmpSum; } result->setDouble(start, len, r); start += len; } return result; }
如何开发用于处理分布式 SQL 的聚合函数
在 DolphinDB 中,SQL 的聚合函数通常接受一个或多个向量作为参数,最终返回一个标量。在开发聚合函数的插件时,需要了解如何访问向量中的元素。
DolphinDB 中的向量有两种存储方式。一种是常规数组,数据在内存中连续存储,另一种是 大数组,其中的数据分块存储。
本章将以编写一个求 几何平均数 的函数为例,介绍如何开发聚合函数,重点关注数组中元素的访问。
聚合函数范例
几何平均数 geometricMean
函数接受一个向量作为参数。为了防止溢出,一般采用其对数形式计算,即
geometricMean([x1, x2, ..., xn]) = exp((log(x1) + log(x2) + log(x3) + ... + log(xn))/n)
为了实现这个函数的分布式版本,可以先开发聚合函数插件 logSum
,用以计算某个分区上的数据的对数和,然后用 defg 关键字定义一个 reduce 函数,用 mapr 关键字定义一个 MapReduce 函数。
在 DolphinDB 插件开发中,对数组的操作通常要考虑它是常规数组还是大数组。可以用 isFastMode
函数判断:
ConstantSP logSum(const ConstantSP &x, const ConstantSP &placeholder) { if (((VectorSP) x)->isFastMode()) { // ... } else { // ... } }
如果是常规数组,它在内存中连续存储。可以用 getDataArray
函数获得它数据的指针。假定数据是以 DOUBLE 类型存储的:
if (((VectorSP) x)->isFastMode()) { int size = x->size(); double *data = (double *) x->getDataArray(); double logSum = 0; for (int i = 0; i < size; i++) { if (data[i] != DBL_NMIN) // is not NULL logSum += std::log(data[i]); } return new Double(logSum); }
如果是大数组,它在内存中分块存储。可以用 getSegmentSize
获得每个块的大小;用 getDataSegment
获得首个块的地址,以返回一个二级指针,指向一个指针数组,这个数组中的每个元素指向每个块的数据数组:
// ... else { int size = x->size(); int segmentSize = x->getSegmentSize(); double **segments = (double **) x->getDataSegment(); INDEX start = 0; int segmentId = 0; double logSum = 0; while (start < size) { double *block = segments[segmentId]; int blockSize = std::min(segmentSize, size - start); for (int i = 0; i < blockSize; i++) { if (block[i] != DBL_NMIN) // is not NULL logSum += std::log(block[i]); } start += blockSize; segmentId++; } return new Double(logSum); }
以上代码针对 DOUBLE 数据类型。在实际开发中,数组的底层存储不一定是 DOUBLE 类型,也可能涉及多种数据类型,此时可采用泛型编程。附件中有一个泛型编程的代码例子。
在 DolphinDB 中调用函数
通常需要实现一个聚合函数的非分布式版本和分布式版本,系统会基于哪个版本更高效来选择调用这个版本。
在 DolphinDB 中定义非分布式的 geometricMean
函数:
def geometricMean(x) { return exp(logSum::logSum(x) \ count(x)) }
然后通过定义 Map 和 Reduce 函数,最终用 mapr
定义分布式的版本:
def geometricMeanMap(x) { return logSum::logSum(x) } defg geometricMeanReduce(myLogSum, myCount) { return exp(sum(myLogSum) \ sum(myCount)) } mapr geometricMean(x) { geometricMeanMap(x), count(x) -> geometricMeanReduce }
如果是在单机环境中执行这个函数,只需要在执行的节点上加载插件。如果有数据位于远程节点,需要在每一个远程节点加载插件。可以手动在每个节点执行 loadPlugin
函数,也可以用以下脚本快速在每个节点上加载插件:
each(rpc{, loadPlugin, pathToPlugin}, getDataNodes())
通过以下脚本创建一个分区表,验证函数:
db = database("", VALUE, 1 2 3 4) t = table(take(1..4, 100) as id, rand(1.0, 100) as val) t0 = db.createPartitionedTable(t, `tb, `id) t0.append!(t) select geometricMean(val) from t0 group by id;
随机访问大数组
可以对大数组进行随机访问,但要经过下标计算。用 getSegmentSizeInBit
函数获得块大小的二进制位数,通过位运算获得块的偏移量和块内偏移量:
int segmentSizeInBit = x->getSegmentSizeInBit(); int segmentMask = (1 << segmentSizeInBit) - 1; double **segments = (double **) x->getDataSegment(); int index = 3000000; // 想要访问的下标 double result = segments[index>> segmentSizeInBit][index & segmentMask]; // ^ 块的偏移量 ^ 块内偏移量
应该选择哪种方式访问向量
上一章 如何开发支持时间序列数据处理的插件函数 介绍了通过 getDoubleConst
, getIntConst
等一组方法获得只读缓冲区,以及通过 getDoubleBuffer
, getIntBuffer
等一组方法获得可读写缓冲区。这两种访问向量的方法在实际开发比较通用。
本章介绍了通过 getDataArray
和 getDataSegment
方法直接访问向量的底层存储。在某些特别的场合,例如明确知道数据存储在大数组中,且知道数据的类型,这种方法比较适合。
如何开发支持新的分布式算法的插件函数
在 DolphinDB database 中,MapReduce 是执行分布式算法的通用计算框架。DolphinDB 提供了 mr 函数和 imr 函数,使用户能通过脚本实现分布式算法。在编写分布式算法的插件时,使用的同样是这两个函数。对通用计算的详细介绍,可以参考通用计算教程。本章主要介绍如何用 C++ 语言编写自定义的 map, reduce 等函数,并调用 mr
和 imr
这两个函数,最终实现分布式计算。
分布式算法范例
本章将使用 mr
,实现一个函数,求分布式表中多个指定列中所有数据的平均值。我们会介绍编写 DolphinDB 分布式算法插件的整体流程,及需要注意的技术细节。
在插件开发中,用户自定义的 map, reduce, final, term 函数,可以是运算符函数,也可以是系统函数。
本例的 map 函数,对表的每个分区内的所有指定列做计算。每个分区返回一个长度为 2 的元组,包含数据之和,以及非空元素的个数。具体实现如下:
ConstantSP columnAvgMap(Heap *heap, vector<ConstantSP> &args) { TableSP table = args[0]; ConstantSP colNames = args[1]; double sum = 0.0; int count = 0; for (int i = 0; i < colNames->size(); i++) { string colName = colNames->getString(i); VectorSP col = table->getColumn(colName); sum += col->sum()->getDouble(); count += col->count(); } ConstantSP result = Util::createVector(DT_ANY, 2); result->set(0, new Double(sum)); result->set(1, new Int(count)); return result; }
本例的 reduce 函数,是对 map 结果的相加。可使用 DolphinDB 的内置函数 add
。用 heap->currentSession()->getFunctionDef("add") 获得这个函数:
FunctionDefSP reduceFunc = heap->currentSession()->getFunctionDef("add");
本例的 final 函数,是对 reduce 结果中的数据总和 sum
和非空元素个数 count
做除法,求得所有分区中对应列的平均数。具体实现如下:
ConstantSP columnAvgFinal(const ConstantSP &result, const ConstantSP &placeholder) { double sum = result->get(0)->getDouble(); int count = result->get(1)->getInt(); return new Double(sum / count); }
定义了 map, reduce, final 等函数后,将它们导出为插件函数(在头文件的函数声明前加上 extern "C" ,并在加载插件的文本文件中列出这些函数),然后通过 heap->currentSession->getFunctionDef 获取这些函数,就能以这些函数为参数调用 mr
函数。如:
FunctionDefSP mapFunc = Heap->currentSession()->getFunctionDef("columnAvg::columnAvgMap");
在本例中,map 函数接受两个参数 table 和 colNames ,但 mr
只允许 map 函数有一个参数,因此需要以 部分应用 的形式调用 map 函数,可以用 Util::createPartialFunction 将它包装为部分应用,实现如下:
vector<ConstantSP> mapWithColNamesArgs {new Void(), colNames}; FunctionDefSP mapWithColNames = Util::createPartialFunction(mapFunc, mapWithColNamesArgs);
用 heap->currentSession()->getFunctionDef("mr") 获得系统内置函数 mr
,调用 mr->call 方法,就相当于在 DolphinDB 脚本中调用 mr
函数。
最后实现的 columnAvg 函数定义如下:
ConstantSP columnAvg(Heap *heap, vector<ConstantSP> &args) { ConstantSP ds = args[0]; ConstantSP colNames = args[1]; FunctionDefSP mapFunc = heap->currentSession()->getFunctionDef("columnAvg::columnAvgMap"); vector<ConstantSP> mapWithColNamesArgs = {new Void(), colNames}; FunctionDefSP mapWithColNames = Util::createPartialFunction(mapFunc, mapWithColNamesArgs); // columnAvgMap{, colNames} FunctionDefSP reduceFunc = heap->currentSession()->getFunctionDef("add"); FunctionDefSP finalFunc = heap->currentSession()->getFunctionDef("columnAvg::columnAvgFinal"); FunctionDefSP mr = heap->currentSession()->getFunctionDef("mr"); // mr(ds, columnAvgMap{, colNames}, add, columnAvgFinal) vector<ConstantSP> mrArgs = {ds, mapWithColNames, reduceFunc, finalFunc}; return mr->call(heap, mrArgs); }
在 DolphinDB 中调用函数
如果是在单机环境中执行这个函数,只需要在执行的节点上加载插件。但如果计算需要用到位于远程节点的数据,就需要在每一个远程节点加载插件。可以手动在每个节点执行 loadPlugin
函数,也可以用以下脚本快速在每个节点上加载插件:
each(rpc{, loadPlugin, pathToPlugin}, getDataNodes())
加载插件后,用 sqlDS
函数生成数据源,并调用函数:
n = 100 db = database("dfs://testColumnAvg", VALUE, 1..4) t = db.createPartitionedTable(table(10:0, `id`v1`v2, [INT,DOUBLE,DOUBLE]), `t, `id) t.append!(table(take(1..4, n) as id, rand(10.0, n) as v1, rand(100.0, n) as v2)) ds = sqlDS(<select * from t>) columnAvg::columnAvg(ds, `v1`v2)
如何开发支持流数据处理的插件函数
在 DolphinDB 中,流数据订阅端可以通过一个 handler 函数处理收到的数据。订阅数据可以是一个数据表,或一个元组,由 subscribeTable
函数的 msgAsTable 参数决定。通常可以用 handler 函数对流数据进行过滤、插入另一张表等操作。
本章将编写一个 handler 函数。它接受的消息类型是元组。另外接受两个参数:一个是 INT 类型的标量或向量 indices,表示元组中元素的下标,另一个是一个表 table。它将元组中对应下标的列插入到表中。
向表中添加数据的接口是 bool append(vector<ConstantSP>& values, INDEX& insertedRows, string& errMsg),如果插入成功,返回 true,并向 insertedRows 中写入插入的行数。否则返回 false,并在 errMsg 中写入出错信息。插件的实现如下:
ConstantSP handler(Heap *heap, vector<ConstantSP> &args) { ConstantSP indices = args[0]; TableSP table = args[1]; ConstantSP msg = args[2]; vector<ConstantSP> msgToAppend; for (int i = 0; i < indices->size(); i++) { int index = indices->get(i); msgToAppend.push_back(msg->get(index)); } INDEX insertedRows; string errMsg; table->append(msgToAppend, insertedRows, errMsg); return new Void(); }
在实际应用中,可能需要知道插入出错时的原因。可以引入头文件 Logger.h,将出错信息写入日志中。注意需要在编译插件时加上宏定义 -DLOGGING_LEVEL_2:
// ...
bool success = table->append(msgToAppend, insertedRows, errMsg);
if (!success)
LOG_ERR("Failed to append to table:", errMsg);
可以用以下脚本模拟流数据写入,验证 handler 函数:
loadPlugin("/path/to/PluginHandler.txt") share streamTable(10:0, `id`sym`timestamp, [INT,SYMBOL,TIMESTAMP]) as t0 t1 = table(10:0, `sym`timestamp, [SYMBOL,TIMESTAMP]) subscribeTable(, `t0, , , handler::handler{[1,2], t1}) t0.append!(table(1..100 as id, take(`a`b`c`d, 100) as symbol, now() + 1..100 as timestamp)) select * from t1
如何开发支持外部数据源的插件函数
在为第三方数据设计可扩展的接口插件时,有几个需要关注的问题:
数据源(Data source)。数据源是一个特殊的数据对象,包含了数据实体的元描述,执行一个数据源能获得数据实体,可能是表、矩阵、向量等等。用户可以提供数据源调用
olsEx
,randomForestClassifier
等分布式计算函数,也可以调用mr
,imr
或 ComputingModel.h 中定义的更底层的计算模型做并行计算。DolphinDB 的内置函数sqlDS
就通过 SQL 表达式获取数据源。在设计第三方数据接口时,通常需要实现一个获取数据源的函数,它将大的文件分成若干个部分,每部分都表示数据的一个子集,最后返回一个数据源的元组。数据源一般用一个 Code object 表示,是一个函数调用,它的参数是元程序,返回一个表。结构(Schema)。表的结构描述了表的列数,每一列的列名和数据类型。第三方接口通常需要实现一个函数,快速获得数据的表结构,以便用户在这个结构的基础上调整列名和列的数据类型。
IO 问题。在多核多 CPU 的环境中,IO 可能成为瓶颈。DolphinDB 提供了抽象的 IO 接口
DataInputStream
和DataOutputStream
。这些接口封装了数据压缩,Endianness,IO 类型(网络,磁盘,buffer 等)等细节,方便开发。此外还特别实现了针对多线程的 IO 实现 (BlockFileInputStream
和BlockFileOutputStream
)。这个实现有两个优点:实现计算和 IO 并行。当一个线程在处理数据的时候,后台线程会异步帮这个线程预读取后面需要的数据。
避免了多线程的磁盘竞争。当线程个数增加的时候,如果并行往同一个磁盘上读写,性能会急剧下降。这个实现,会对同一个磁盘的读写串行化,从而提高吞吐量。
本章将介绍通常需要实现的几个函数,为设计第三方数据接口提供一个简单的范例。
数据格式描述
假定本例中的数据储存在 平面文件数据库,以二进制格式按行存储,数据从文件头部直接开始存储。每行有四列,分别为 id(按有符号 64 位长整型格式存储,8 字节),symbol(按 C 字符串格式以 ASCII 码编码存储,8 字节),date(按 BCD 码格式存储,8 字节),value(按 IEEE 754 标准的双精度浮点数格式存储,8 字节),每行共 32 字节。以下是一行的例子:
id | symbol | date | value |
---|---|---|---|
5 | IBM | 20190313 | 10.1 |
这一行的十六进制表示为:
0x 00 00 00 00 00 00 00 05
0x 49 42 4D 00 00 00 00 00
0x 02 00 01 09 00 03 01 03
0x 40 24 33 33 33 33 33 33
extractMyDataSchema
函数
这个函数提取数据文件的表结构。在本例中,表结构是确定的,不需要实际读取文件。通过 Util::createTable 函数创建一张结构表:
ConstantSP extractMyDataSchema(const ConstantSP &placeholderA, const ConstantSP &placeholderB) { ConstantSP colNames = Util::createVector(DT_STRING, 4); ConstantSP colTypes = Util::createVector(DT_STRING, 4); string names[] = {"id", "symbol", "date", "value"}; string types[] = {"LONG", "SYMBOL", "DATE", "DOUBLE"}; colNames->setString(0, 4, names); colTypes->setString(0, 4, types); vector<ConstantSP> schema = {colNames, colTypes}; vector<string> header = {"name", "type"}; return Util::createTable(header, schema); }
在实际开发中,可能需要以读取文件头等方式获得表结构。如何读文件将在后面介绍。
loadMyData
函数
loadMyData
函数读取文件,并输出一张 DolphinDB 表。给定一个文件的路径,可以通过 Util::createBlockFileInputStream 创建一个输入流,此后,可对这个流调用 readBytes
函数读取给定长度的字节,readBool
读取下一个 bool 值,readInt
读取下一个 int 值,等等。本例给 loadMyData
函数设计的语法为:loadMyData(path, [start], [length])
。除了接受文件路径 path ,还接受两个 INT 类型的参数 start 和 length,分别表示开始读取的行数和需要读取的总行数。createBlockFileInputStream
函数可以通过参数决定开始读取的字节数和需要读取的总字节数。
ConstantSP loadMyData(Heap *heap, vector<ConstantSP> &args) { ConstantSP path = args[0]; long long fileLength = Util::getFileLength(path->getString()); size_t bytesPerRow = 32; int start = args.size()>= 2 ? args[1]->getInt() : 0; int length = args.size()>= 3 ? args[2]->getInt() : fileLength / bytesPerRow - start; DataInputStreamSP inputStream = Util::createBlockFileInputStream(path->getString(), 0, fileLength, Util::BUF_SIZE, start * bytesPerRow, length * bytesPerRow); char buf[Util::BUF_SIZE]; size_t actualLength; while (true) { inputStream->readBytes(buf, Util::BUF_SIZE, actualLength); if (actualLength <= 0) break; // ... } }
在读取数据时,通常将数据缓存到数组中,等待缓冲区满后批量插入。例如,假定要读取一个内容全为 CHAR 类型字节的二进制文件,将它写入一个 CHAR 类型的 DolphinDB 向量 vec,最后返回只由 vec 一列组成的表:
char buf[Util::BUF_SIZE]; VectorSP vec = Util::createVector(DT_CHAR, 0); size_t actualLength; while (true) { inputStream->readBytes(buf, Util::BUF_SIZE, actualLength); if (actualLength <= 0) break; vec->appendChar(buf, actualLength); } vector<ConstantSP> cols = {vec}; vector<string> colNames = {"col0"}; return Util::createTable(colNames, cols);
本节的完整代码请参考附件中的代码。在实际开发中,加载数据的函数可能还会接受表结构参数 schema,按实际需要改变读取的数据类型。
loadMyDataEx
函数
loadMyData
函数将数据加载到内存,当数据文件非常庞大时,工作机的内存很容易成为瓶颈。所以设计 loadMyDataEx
函数解决这个问题。它通过边导入边保存的方式,把静态的二进制文件以较为平缓的数据流的方式保存为 DolphinDB 的分布式表,而不是采用全部导入内存再存为分区表的方式,从而降低内存的使用需求。
loadMyDataEx
函数的参数可以参考 DolphinDB 内置函数 loadTextEx
。它的语法是:loadMyDataEx(dbHandle, tableName, partitionColumns, path, [start], [length])。如果数据库中的表存在,则将导入的数据添加到已有的表 result 中。如果表不存在,则创建一张表 result,然后添加数据。最后返回这张表。
string dbPath = ((SystemHandleSP) db)->getDatabaseDir(); vector<ConstantSP> existsTableArgs = {new String(dbPath), tableName}; bool existsTable = heap->currentSession()->getFunctionDef("existsTable")->call(heap, existsTableArgs)->getBool(); // 相当于 existsTable(dbPath, tableName) ConstantSP result; if (existsTable) { // 若表存在,加载表 vector<ConstantSP> loadTableArgs = {db, tableName}; result = heap->currentSession()->getFunctionDef("loadTable")->call(heap, loadTableArgs); // 相当于 loadTable(db, tableName) } else { // 若表不存在,创建表 TableSP schema = extractMyDataSchema(new Void(), new Void()); ConstantSP dummyTable = DBFileIO::createEmptyTableFromSchema(schema); vector<ConstantSP> createTableArgs = {db, dummyTable, tableName, partitionColumns}; result = heap->currentSession()->getFunctionDef("createPartitionedTable")->call(heap, createTableArgs); // 相当于 createPartitionedTable(db, dummyTable, tableName, partitionColumns) }
读取数据并添加到表中的代码实现采用了 pipeline 框架。它的初始任务是一系列具有不同 start 参数的 loadMyData
函数调用,pipeline 的 follower
函数是一个部分应用 append!,相当于把整个读取数据的任务分成若干份执行,调用 loadMyData
分块读取后,将相应的数据通过 append!
插入表中。核心部分的代码如下:
int sizePerPartition = 16 * 1024 * 1024; int partitionNum = fileLength / sizePerPartition; vector<DistributedCallSP> tasks; FunctionDefSP func = Util::createSystemFunction("loadMyData", loadMyData, 1, 3, false); int partitionStart = start; int partitionLength = length / partitionNum; for (int i = 0; i < partitionNum; i++) { if (i == partitionNum - 1) partitionLength = length - partitionLength * i; vector<ConstantSP> partitionArgs = {path, new Int(partitionStart), new Int(partitionLength)}; ObjectSP call = Util::createRegularFunctionCall(func, partitionArgs); // 将会调用 loadMyData(path, partitionStart, partitionLength) tasks.push_back(new DistributedCall(call, true)); partitionStart += partitionLength; } vector<ConstantSP> appendToResultArgs = {result}; FunctionDefSP appendToResult = Util::createPartialFunction(heap->currentSession()->getFunctionDef("append!"), appendToResultArgs); // 相当于 append!{result} vector<FunctionDefSP> functors = {appendToResult}; PipelineStageExecutor executor(functors, false); executor.execute(heap, tasks);
本节的完整代码请参考附件中的代码。用 Pipeline 框架实现数据的分块导入,只是一种思路。在具体开发时,可以采用 ComputingModel.h 中声明的 StaticStageExecutor
,也可以使用 Concurrent.h 中声明的线程模型 Thread。实现方法有很多种,需要根据实际场景选择。
myDataDS
函数
myDataDS
函数返回一个数据源的元组。每个数据源都是一个表示函数调用的 Code object,可以通过 Util::createRegularFunctionCall 生成。执行这个对象可以取得对应的数据。以下是基于 loadMyData
函数产生数据源的一个例子:
ConstantSP myDataDS(Heap *heap, vector<ConstantSP> &args) { ConstantSP path = args[0]; long long fileLength = Util::getFileLength(path->getString()); size_t bytesPerRow = 32; int start = args.size()>= 2 ? args[1]->getInt() : 0; int length = args.size()>= 3 ? args[2]->getInt() : fileLength / bytesPerRow - start; int sizePerPartition = 16 * 1024 * 1024; int partitionNum = fileLength / sizePerPartition; int partitionStart = start; int partitionLength = length / partitionNum; FunctionDefSP func = Util::createSystemFunction("loadMyData", loadMyData, 1, 3, false); ConstantSP dataSources = Util::createVector(DT_ANY, partitionNum); for (int i = 0; i < partitionNum; i++) { if (i == partitionNum - 1) partitionLength = length - partitionLength * i; vector<ConstantSP> partitionArgs = {path, new Int(partitionStart), new Int(partitionLength)}; ObjectSP code = Util::createRegularFunctionCall(func, partitionArgs); // 将会调用 loadMyData(path, partitionStart, partitionLength) dataSources->set(i, new DataSource(code)); } return dataSources; }
如何在插件代码中构造并使用 sql 语句
DolphinDB 的脚本语言中提供了两个用于构造 SQL 语句的函数:sql
函数和 parseExpr
函数。这两个函数都能够在插件代码中构造 SQL 或在插件代码中更灵活地使用 SQL 语句。本章以 parseExpr
函数为例介绍如何在插件代码中使用 SQL 语句。
使用步骤
引入 ScalarImp.h 头文件
通过 parseExpr
函数生成 SQL 语句时,解析执行的过程中需要用到 String 类型,而 String 类型是 DolphinDB 内置的一个 Scalar 类型,其类定义在插件库中 ScalarImp.h 这个头文件。因此, 需要先引入该头文件:
#include "ScalarImp.h"
将待查询的 Table 对象放入 Heap 中
插件中定义的函数第一个参数是 heap 对象,当通过脚本调用插件中的接口时能获取到这个对象。通过 heap 对象的 addItem
接口可以将 table 对象放入 heap 中维护。addItem
接口有两个参数:第一个参数为对象的名字,需要设置为 SQL 查询语句中 from 关键字后跟随的字符串;第二个参数为 table 对象。
在以下例子中,首先通过 heap->addItem(“t“, t)
构造一个名为 "t"的 table 对象 t:
vector<string> colNames {"id", "x"};
vector<DATA_TYPE> colTypes {DT_SYMBOL, DT_DOUBLE};
TableSP t = Util::createTable(colNames, colTypes, 0, 8);
heap->addItem("t", t);
之后就可以在以下这个 SQL 语句中使用字符串 ”t” 指代被查询的 table:
select * from t;
拼接 sql 字符串
接下来,我们可以将执行 select * from t
的结果赋予名为 sql 的字符串,其中,字符串 "t" 用于在以下的例子中指代上一节提到的 table t:
代码示例:
string sql = "select * from t"
执行 sql
执行 sql 分为两步:
- 通过parseExpr函数将sql语句解析为元代码。即,在插件代码中,通过
heap->currentSession()->getFunctionDef("parseExpr")
获取函数对象。 - 通过eval函数执行解析后的元代码。即,将参数的参数组织为
vector<ConstantSP>
的形式用于调用。
执行 sql 的示例如下:
string sql = "select * from t";
ConstantSP sqlArg = new String(DolphinString(sql));
vector<ConstantSP> args{sqlArg};
ObjectSP sqlObj = heap->currentSession()->getFunctionDef("parseExpr")->call(heap, args);
vector<ConstantSP> evalArgs{sqlObj};
ConstantSP ret = heap->currentSession()->getFunctionDef("eval")->call(heap, evalArgs);
完整代码示例
select * from t
的完整代码示例
vector<string> colNames {"id", "x"};
vector<DATA_TYPE> colTypes {DT_SYMBOL, DT_DOUBLE};
TableSP t = Util::createTable(colNames, colTypes, 0, 8);
ConstantSP idData = Util::createVector(DT_SYMBOL, 0, 0);
ConstantSP xData = Util::createVector(DT_DOUBLE, 0, 0);
string testId("APPL");
double testX(100.1);
((Vector*)(idData.get()))->appendString(&testId, 1);
((Vector*)(xData.get()))->appendDouble(&testX, 1);
vector<ConstantSP> data = {idData, xData};
INDEX rows=0;
string errMsg;
t->append(data, rows, errMsg);
heap->addItem("t", t);
string strData = t->getString();
string sql = "select * from t";
ConstantSP sqlArg = new String(DolphinString(sql));
vector<ConstantSP> args{sqlArg};
ObjectSP sqlObj = heap->currentSession()->getFunctionDef("parseExpr")->call(heap, args);
vector<ConstantSP> evalArgs{sqlObj};
ConstantSP ret = heap->currentSession()->getFunctionDef("eval")->call(heap, evalArgs);
select avg(x) from t
的完整代码示例
vector<string> colNames {"id", "x"};
vector<DATA_TYPE> colTypes {DT_SYMBOL, DT_DOUBLE};
TableSP t = Util::createTable(colNames, colTypes, 0, 8);
ConstantSP idData = Util::createVector(DT_SYMBOL, 0, 0);
ConstantSP xData = Util::createVector(DT_DOUBLE, 0, 0);
string testId("APPL");
double testX(100.1);
((Vector*)(idData.get()))->appendString(&testId, 1);
((Vector*)(xData.get()))->appendDouble(&testX, 1);
vector<ConstantSP> data = {idData, xData};
INDEX rows=0;
string errMsg;
t->append(data, rows, errMsg);
heap->addItem("t", t);
string strData = t->getString();
string sql = "select avg(x) from t";
ConstantSP sqlArg = new String(DolphinString(sql));
vector<ConstantSP> args{sqlArg};
ObjectSP sqlObj = heap->currentSession()->getFunctionDef("parseExpr")->call(heap, args);
vector<ConstantSP> evalArgs{sqlObj};
ConstantSP ret = heap->currentSession()->getFunctionDef("eval")->call(heap, evalArgs);
常见问题
如何处理开发的 windows 版本插件加载时的错误提示:"The specified module could not be found"?
MinGW 中包含 gcc, g++ 等多种编译器,下载时请选择 x86_64-posix-seh 版本(posix 表示启用了 C++ 11 多线程特性,seh 表示异常分支处理零开销),以与 DolphinDB server 保持一致。若下载安装了 x86_64-posix-sjlj 或其他版本,某些插件能编译成功,但会加载失败,提示:The specified module could not be found。
插件开发时需要包含哪些库和头文件?
DolphinDB 插件代码存储于 github/gitee 的 dolphindb/DolphinDBPlugin,其中的 include 目录包含了 DolphinDB 的核心数据结构的类声明和部分工具类声明。这些类是实现插件的重要基础工具,开发插件时需要包含 include 目录下的头文件。
链接时,需要包含库目录(libDolphinDB.dll/libDolphinDB.so 所在目录),即安装 DolphinDB 的目录。
编译时需要包含哪些选项?
windows 版本要添加 “WINDOWS”,Linux 版本要添加 “LINUX”。对 release130 及以上分支,添加选项 "LOCKFREE_SYMBASE"。另外,为了兼容旧版本的编译器,libDolphinDB.so 编译时使用了 _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 的选项,因此用户在编译插件时也应该加入该选项。若 libDolphinDB.so 编译时使用 ABI=1,编译插件时则无需添加 _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 的选项。
编译步骤可参考已实现的插件案例,例如 NSQ 插件的 CMakeList.txt。
如何处理编译时出现包含 std::__cxx11 字样的链接问题(undefined reference)?
请检查用于编译插件的 gcc 版本,建议其和编译 DolphinDB server 的 gcc 版本保持一致。例如普通的 Linux64 版本用 gcc 4.8.5 版本,jit 版本使用 gcc 6.2.0 版本。
如何加载插件,可以卸载后重新加载吗?
插件的加载方式有 2 种:第 1 种,使用 loadPlugin 函数加载插件。该函数接受一个描述插件格式的文件的路径, 例如:
loadPlugin("/<YOUR_SERVER_PATH>/plugins/odbc/PluginODBC.txt");
注意:格式文件介绍详见插件 插件格式, 其中文件第一行规定了 lib 文件名以及路径。缺省不写路径,即需要插件库与格式文件在同一个目录。
第 2 种,DolphinDB Server 1.20.0 及以上版本,可以通过 preloadModules 参数来自动加载。使用这个方法时需要保证预先加载的插件存在,否则 server 启动时会有异常。多个插件用逗号分离。例如:
preloadModules=plugins::mysql,plugins::odbc
已加载的插件不能卸载。重新加载需要重启节点。
如何处理执行插件函数时的报错信息:"Connnection refused:connect" 或节点 crash 问题?
确保 include 下的头文件和 libDolphinDB.so 或 libDolphinDB.dll 实现保持一致。插件分支应与 DolphinDB Server 的版本相匹配,即若 DolphinDB Server 是 1.30 版本,插件应用 release130 分支,若 DolphinDB Server 是 2.00 版本,插件应该用 release200 分支,其他版本依此类推。
确保用于编译插件的 gcc 版本和编译 libDolphinDB.so 或 libDolphinDB.dll 的版本保持一致,以免出现不同版本的编译器 ABI 不兼容的问题。
插件与 DolphinDB server 在同一个进程中运行,若插件 crash,那整个系统就会 crash。因此在开发插件时要注意完善错误检测机制,除了插件函数所在线程可以抛出异常(server 在调用插件函数时会俘获异常),其他线程都必须自己俘获异常,并不得抛出异常。
确保编译选项中已经添加宏 LOCKFREE_SYMBASE。
如何处理执行插件函数时的错误提示:"Cannot recognize the token xxx"?
使用前需引入插件的命名空间,例如:
use demo;
或者函数前加上模块名称,例如:
demo::f1();